morfofonologija (morfonologija), dio gramatike koji se bavi fonemskim sastavom morfemâ i vezom između građe morfemâ i njihova funkcioniranja. Tako se u nas bavi alternacijama ili zamjenjivanjima (fonološki uvjetovane alternacije jesu npr. jednačenje suglasnika po zvučnosti, npr. vrabac–vrapca, promičem–promidžba; jednačenje suglasnika po mjestu tvorbe, npr. nositi–nošnja, stan–stambeni itd.; gubljenje suglasnika, npr. bezvučan prema *bezzvučan, čakovečki prema *čakovečski, itd.; morfološki uvjetovane alternacije jesu npr. nepostojani samoglasnici, npr. kakav, gen. kakva, kratak, ž. kratka, sr. kratko, Čakovec–Čakovca, itd.; vokalizacija l, npr. čitao prema *čital, čitala, čitalo; palatalizacija, npr. ruka–ručica; sibilarizacija, npr. ruka, dat. ruci; alternacije ije/je/e/i/0, itd.).