anatoksin (grčki: ana nad, toksikon otrov), toksoid, bakterijski toksin kojem su fizikalnim i kemijskim putem uklonjena otrovna svojstva. Anatoksin je zadržao imunogeno svojstvo, tj. poticanje stvaranja protutijela (antitoksin) pa se rabi kao cjepivo (napose protiv tetanusa i difterije, u veterinarstvu protiv šuštavca i goveđe kuge).